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細胞學內容

胞囊纖維化症

Cystic fibrosis胞囊纖維化症的CFTR蛋白第508位置的Phe缺失,是protein folding問題。

RBC

RBC(ankyrin、spectrin、actin)呈球型→ankyrin-1 gene有問題。

 

主動運輸ABC transporter→1.CFTR 氯離子Channel. 2.MDR1-cancer cell上

(題庫1)

EDS(Ehlers-Danlos)先天膠原結締組織異常=鬆皮症=橡皮人

 

類型

特徵

遺傳模式

突變基因

 

1.(2)(3)

皮膚細薄光滑,關節過度變形。

體顯

COL5A gene

 

4.

皮膚薄細

體顯

COL3A1 gene

 

6.

柔軟皮膚

體隱

PLOD gene

 

9.

膀胱憩室,脊椎側凸。

X隱

MNK gene

分子生物內容

GTF binding順序

D→B→F→E→H

RNase

1. Dicer 2. drosha

 

人(2)←猩猩(12)(13)

人(16)←老鼠(7)(8)(16)(17)

 

Activator= transactivator

1. Gal4p 2. SR

具端粒酶

  1. cancer cell 2. stem cell 3. 特定生殖細胞

具光修補機制

1.原核生物2.金魚3.眼鏡蛇類4.有袋類5.酵母菌

具helicase活性

1.ρfactor 2. DNA B 3. TFIIH 4.unrD

真核無TATA box

1. housekeeping gene 2. homeotic gene

 

人的基因組中,transposon佔45%為什麼突變率沒有增加?

1.transposon結構不全2.transposon位在異染色質3.gene調控RNAi

遺傳密碼不普遍性

1. MT DNA 2. Mycolpasma 3. 草履蟲 4. 四膜蟲

內切酶

1. Cas-9 2. 限制酶3. transposase 4. RNaseP

迴文序列

1. 原核轉錄終止ρ-independent 2. DNA transposon 3. 調節蛋白與DNA結合4. CRISPR 5. 限制酶

具intron

1.真核生物2.古細菌3.病毒

真核不具intron

baker yeast

真核生物有operon

1線蟲.2.cp DNA

線型MT DNA

1.萊茵衣藻2.奧里利亞草履蟲

Y染色體

MT DNA

CP DNA

78個基因

37個基因、無intron、無histone

100~200個基因、無histone

促肌肉形成

MyoA、MyoH、MyoD(HLH)

核等價

1. 基因擴增2. 基因重排

蛙眼誘導化學訊號來自

1. 大腦2. 神經板

C. logans

Lin12:RTK(陰部形成)、Lin4:miRNA(RNAi)

細胞質決定物

卵黃、P顆粒、bicoid mRNA、nanos mRNA

Inducer

初級、次級

型態生成素

Activin、noggin、wnt、bicoid protein、nanos protein

果蠅基因

胚胎發育需要1200個基因、120個基因:樣式形成促正常體節形成。

體節形成

Gap gene

突變後身體有大段缺失

Pair-rule gene

體節數目少一半

體節極性基因

鏡像副本

軟體

BLAST:基因比對、Gn3D:蛋白質3級結構、MEGA:建構演化樹

基因組最大

polychaos dubium無恆變形蟲:670billion units

基因組最小

Viroid family:220nucletides

GFP

綠色螢光蛋白

原核細胞1-10um

gene密度1000個gene/Mb

真核細胞10-100um

gene密度10-200個gene/Mb

人:3109bps

人:21300個基因

人:7個/70%交替剪接

HOTAIR

和乳癌有關

流感病毒

血細胞凝集素(HA):H抗原(16種)和神經胺酶(NA):N抗原(9種)

反轉錄病毒

1.gag:外殼2.pol:反轉錄酶、插入酶、蛋白酶3.env:形成spike(gp14、gp120)

誘導式富潛能幹細胞IPS

Oct- 3,4、Sox-2、c-Myc、Klf-4為oncogene可能使細胞癌化

雞和鴨的腳蹼

[BMP4]↑[gremlin]↓:apotosis

[BMP4]↑[gremlin]↑:apotosis

產生FAS ligand

1. tumor cell 2. 賽托利細胞(破壞進入的T cell)

             

 

Oncogene

位置

原致癌基因功能

 

sis

細胞外

GF

為血小板衍生物的生長因子

erbB

細胞膜

部分GF 受器

生長因子受體,可加強生長因子訊號

erbA

細胞膜

甲狀腺受器

 

src

細胞膜

protein tyrosine kinase

tyrosine kinase,可活化kinase cascade

ras

細胞膜

G-protein

 

myc

細胞核

轉錄因子

※轉錄因子若表現量過多,細胞會快速增生分裂,導致癌化

fos

細胞核

轉錄因子

轉錄因子

jun

細胞核

轉錄因子

 

Bcl-1

細胞核

Cell cycle

 

 

腫瘤抑制基因(TSG)名稱

功能

FHIT

功能不清楚。

PTEN

中國內轉。

維持基因整合

P53

偵測DNA受損,並促進細胞的修復或凋亡。

BRCA-1

偵測DNA受損,並促進細胞的修復。

BRCA-2

偵測DNA受損,並促進細胞的修復。

XPD

出現在tumor suppressor gene修復的基因中。

負向調節細胞分裂

Rb

抑制轉錄細胞週期和分裂所需的基因。

NF1

促使PAS(GTP→GDP)。失去此基因會使RAS過度活化。

P16

抑制CDK。

 

乳癌類型

主因

比率

治療

Luminal A

ERα++/ PR++/ HER2-

40%

Tamoxifen

Luminal B

ERα++/ PR++/ HER2-

15~20%

Tamoxifen

Her2

ERα-/ PR-/ HER2++

10~15%

Herceptin

Basal-like

ERα-/ PR-/ HER2-

15~20%

化療

 

大腸癌的形成

APC→ras基因→DCC基因→(SMAD4) →p53抑癌基因

 

耗2個pi

DNA複製

C4pathway:pyruvate→PEP

DNA轉錄

AA活化(/直接:GTP/間接:ATP)

RNA轉譯

Fa活化

糖質新生:6pi(most)

Urea cycle:4pi

 

 

生長素receptor

細胞內TIR1 receptor(沒說,當細胞內以此為主

細胞膜上ABP1 receptor

CK receptor

細胞膜上AHK receptor

GA receptor

GID1蛋白質細胞內核膜上

植物極性運輸

(木質部薄壁細胞)

生長素運入carrier=AUX1

生長素運出carrier=PIN蛋白質

植物對病原菌防衛

植物R基因與Avr-R 基因辨認→HR反應(PR gene活化)

Phytoalexins植物性殺菌素

PR proteins

多醣強化細胞壁

保衛細胞控制生長的基因

SPEECHLESS→MUTE→FAMA

開花激素

Florigen(FT gene) →FT protein 與FD transcription結合→LEAFY(LFY protein) →許多 floral-identity genes

根瘤形成

跟分泌類黃酮→活化根留調節基因Nod D→與Nod box結合活化Nod基因轉錄→Nod enzyme→代謝產生幾丁質的物質(Nod factor)→nodulins根瘤蛋白→根感染絲的形成和皮層細胞分裂→活化植物早期根瘤基因

tangled-1

 與植物玉米表皮細胞排列有關,若突變,垂直延長排列有問題,會造成表皮細胞彎曲排列。

fass gene

(阿拉伯芥的基因與細胞分裂與擴張有關)若突變MT會位置會隨機散佈,prephase bands也不會在有絲分裂前形成。

Cycloidea gene

花形成徑向對稱基因。

POP2 gene

(阿拉伯芥的基因)降解GABA形成濃度梯度(柱頭低→胚囊高)以引導花粉管到卵。

Gnom gene

阿拉伯芥胚軸的形成

floral meristem identity genes

番茄的花分生確認基因。

MADS BOX gene

阿拉伯芥器官確認基因:

MCM1酵母

DEFA金魚草

AG阿拉伯芥

SRF動物血清應激分子

生理和分類學相關

阿滋海默症致病基因:

1.βAPP基因(21號)→βAPP蛋白

2.APOE(19號)

巴金森氏症致病基因:

1.α-synuclein

2.Parkin gene→parkin protein

3.DJ-1

4.LRRK2→震顫素

5.PINK1

6.UCHL1

GCSK9 gene

肝臟產生GCSK9蛋白;[GCSK9蛋白]↑[LDL]↑

人類腦部體積增大

MCPH1、ASPM

人類語言相關基因

FOXP2(鳥類也具有)

EPAS-1

可影響人類血液中的氧氣,存在丹尼索瓦人、西藏人體內

DLX

形成基因的複雜性和脊椎動物的神經系統、骨骼組成有關

Pitxl

淡水魚的骨刺

HoxD13

突變造成多指症

HoxA-3

對身體前半部分發展重要(包含頸部);如果剔除造成異常血管、頸部的甲狀腺、副甲狀腺、胸線不會正常發育。

Tinman gene 

心臟位置的形成

Oca2 gene

眼色

PAX6 gene

眼睛形成

生物時鐘節律相關的Gene

CLK、CYC轉錄因子→PER蛋白和TIM蛋白(由基因 timeless 而來)→形成PER-TIM 蛋白複合體→進入細胞核抑制CLK、CYC轉錄因子作用→PER-TIM 蛋白複合體逐漸降解→CLK、CYC轉錄因子恢復功能

BMAL-1

台灣生態相關

國家公園

台灣9國家公園,18自然保留區,14野生動物保護區

         

 

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